Z/X: Код воссоединения

После долгой и кровопролитной войны между людьми и зексами, иноземными созданиями из пяти параллельных миров, наступает хрупкое перемирие. В этот раз спасение миров зависит от маленькой и болезненной девочки по имени Адзуми Кагамихара и её партнера, зекса из Голубого Мира, известного как Ригель. Однако, прежде чем они смогут взять на себя эту ответственность, Адзуми должна пройти обучение в Академии Фудзимисаки, специальной школе, созданной для подготовки таких пар.

После поступления в академию, Адзуми знакомится с другими ученицами, каждая из которых также связана с зексом. Вместе они начинают свой путь обучения, наполненный тяжелыми тренировками и испытаниями. Академия становится местом, где девочки учатся управлять своими силами и синергии с зексами, готовясь к будущим миссиям, которые определят судьбу их миров.

Тем временем, в мире за пределами академии, хрупкое перемирие все больше трещит по швам. Адзуми и её друзья понимают, что их обучение и подготовка не просто учеба, а реальная подготовка к битве, которая может вновь ввергнуть мир в хаос. В этой напряженной атмосфере, каждый день в академии приобретает все большее значение, ведь каждое испытание и каждая тренировка могут стать ключом к спасению или гибели их миров.